Show simple document record

dc.contributor.advisorLafontaine, Daniel
dc.contributor.advisorAbou Elela, Sherif
dc.contributor.advisorGirard, Gabriel
dc.contributor.authorGagnon, Julesfr
dc.date.accessioned2014-12-23T14:52:01Z
dc.date.available2014-12-23T14:52:01Z
dc.date.created2014fr
dc.date.issued2014-12-23
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11143/5983
dc.description.abstractLes endoribonucléases III sont conservées chez tous les eucaryotes. Ils jouent un rôle important dans le cycle de vie des acides ribonucléiques (ARN) que ce soit au niveau de leur maturation, leur régulation ou leur dégradation. Cependant, seul un petit nombre d'ARN ciblés par les ribonucléases (RNases) III sont connus et les motifs reconnus par l'enzyme sont encore mal caractérisés. Actuellement, la découverte de nouvelles cibles repose principalement sur la validation in vitro de gènes individuels. Il est important d'avoir une vue d'ensemble des cibles des RNases III pour comprendre le rôle de la dégradation spécifique des ARN dans le métabolisme cellulaire. Ainsi, cette thèse a comme objectif de développer des approches haut débit pour permettre une identification plus rapide des cibles tout en minimisant l'utilisation des ressources expérimentales. Elle présente l'utilisation combinée d'approches bio-informatiques, d'étude génétique de l'expression et de traitement in vitro dans le but d'avoir un portrait global des cibles de l'endoribonucléase III. Elle a aussi comme but d'identifier les motifs d'ARN non codants qui guident la reconnaissance par l'endoribonucléase III. Les principaux accomplissements de cette recherche sont : le développement de nouveaux algorithmes de prédiction des cibles de la RNase III, la détection de deux nouvelles classes de transcrits dont l'expression est dépendante de la RNase III, l'identification de quelques centaines de nouvelles cibles de la RNase III, la production d'un catalogue plus complet des motifs coupés par la RNase III et l'identification de nouvelles catégories de motifs coupées par la RNase III. Le tout procure un portrait global de l'impact de la RNase III sur le transcriptome et le cycle de vie des ARN. De plus, ce travail montre comment une approche intégrée incluant la recherche in silico, in vivo et in vitro permet de mieux comprendre le rôle d'un enzyme dans la cellule et comment chaque approche peut pallier les déficiences des autres approches et fournir globalement des résultats plus complets.fr
dc.language.isofrefr
dc.publisherUniversité de Sherbrookefr
dc.rights© Jules Gagnonfr
dc.subjectARNfr
dc.subjectARNncfr
dc.subjectARNsnofr
dc.subjectRNT1fr
dc.subjectRnt1pfr
dc.subjectRNase IIIfr
dc.subjectApprentissage machinefr
dc.subjectPuces à ADNfr
dc.titleUne approche bio-informatique intégrée pour l'identification des cibles ARN de l'endoribonucléase III chez la levurefr
dc.typeThèsefr
tme.degree.disciplineBiologiefr
tme.degree.grantorFaculté des sciencesfr
tme.degree.levelDoctoratfr
tme.degree.namePh.D.fr


Files in this document

Thumbnail

This document appears in the following Collection(s)

Show simple document record