Identification de cibles fonctionnelles de facteurs [sigma] chez Mycobacterium tuberculosis

Abstract

Depuis des milliers d'années, un nombre considérable d'individus sont décédés de la tuberculose. En dépit des progrès fulgurants de la médecine moderne, Mycobacterium tuberculosis, l'agent causal de cette maladie, infecte actuellement près du tiers de l'humanité et tue environ deux millions de personnes chaque année. L'établissement d'une infection par ce pathogène nécessite une adaptation successive à divers environnements difficiles. Une régulation efficace de l'expression des gènes de M. tuberculosis est essentielle au succès de ces événements. Chez les procaryotes, l'initiation de la transcription constitue la principale étape dans le contrôle de l'expression génique. Les facteurs [sigma], responsables de la reconnaissance des promoteurs, jouent un rôle indispensable dans ce processus. Treize facteurs sigma ([sigma]) ont été prédits à partir de la séquence du génome de M. tuberculosis. Cependant, relativement peu d'informations sont disponibles quant aux groupes de gènes directement régulés par chacun de ceux-ci. L'objectif de cette thèse consistait donc à identifier des cibles directes de facteurs [sigma] de M. tuberculosis et à définir les séquences promotrices que ces protéines reconnaissent. Deux approches ont été utilisées. Tout d'abord, des essais de transcription in vitro ont permis de déterminer la nature des facteurs [sigma] impliqués dans la transcription de divers gènes. Des facteurs anti-[sigma] ont aussi été étudiés à l'aide de ce système. Une attention particulière a été portée au facteur [sigma][indice supérieur L] et à son facteur anti-[sigma] respectif. Ensuite, des essais d'immunoprécipitation de la chromatine ont été réalisés afin de découvrir des sites de liaison de facteurs [sigma] in vivo. Plusieurs gènes ont ainsi pu être associés au facteur [sigma] responsable de leur expression. Une meilleure compréhension des mécanismes et des programmes d'expression de gènes chez ce pathogène pourrait conduire à l'élaboration de nouveaux modes de traitements et de prévention de la tuberculose.