Détermination de la structure secondaire de TLC1, l'ARN de la télomérase chez Saccharomyces spp. par analyse phylogénétique

Abstract

Chez la plupart des eucaryotes, les télomères sont constitués de séquences répétitives d'acide déoxyribonucléique (ADN) formant des complexes avec une multitude de protéines. La capacité des séquences télomériques et sous-télomériques à s'associer de façon transitoire et constitutive à diverses protéines confère aux extrémités chromosomiques une structure particulière appelée télosome. Certains complexes présents au télosome sont capables de contrebalancer l'érosion de l'ADN télomérique inhérente aux limitations des ADN polymérases conventionnelles. La télomérase, un des complexes retrouvés au télosome, est une ribonucléoprotéine (RNP) qui utilise un mécanisme de transcription inverse afin de répliquer la toute fin des chromosomes. La composante acide ribonucléique (ARN) de la télomérase est essentielle pour l'assemblage et l'activité catalytique de la RNP. Dans certains types cellulaires et selon l'état physiologique de la cellule, d'autres mécanismes indépendants de la télomérase sont mis à contributions pour compenser efficacement la perte de séquences télomériques. La dysfonction de tous ces mécanismes de maintien de l'homéostasie de la longueur des télomères se manifeste chez l'humain par des situations pathologiques. Dans notre laboratoire, la levure Saccharomyces cerevisiae est utilisée comme organisme modèle pour comprendre la structure et la fonction des télomères. La levure est un organisme de choix pour les analyses génétiques et plusieurs aspects de la biologie des télomères sont conservés entre la levure et les humains. Nous avons avantageusement utilisé S. cerevisiae pour l'étude de divers mécanismes de stabilisation des télomères. Dans une première étude, nous avons voulu confirmer des résultats préliminaires relatifs à un rôle éventuel de la protéine Cdc13p dans l'initiation de la réplication à partir des télomères. Nous avons utilisé une souche de levure dont le gène CDC13 comporte une mutation qui empêche la protéine de recruter la télomérase aux télomères. Nous avons comparé les profils de réplication en gel à deux dimensions (gel 2D) d'un chromosome artificiel introduit dans une souche sauvage et une souche mutante pour Cdc13p. Les intermédiaires caractéristiques d'une réplication initiée par l'extrémité d'un fragment d'ADN ne sont pas détectables.--Résumé abrégé par UMI.