Étude du réseau d'interactions tertiaires au sein du site catalytique du ribozyme delta par méthode de SELEX

Abstract

Le virus de l'hépatite delta humaine (VHD) est un pathogène infectieux qui est associé à une hépatite fulminante chez l'humain. Ce virus possède un génome circulaire d'ARN simple brin comportant deux régions auto-catalytiques (ribozymes). Ce présent travail a pour but d'étudier le mécanisme moléculaire ainsi que le sentier de repliement tridimensionnel subit par ce ribozyme au cours de l'événement de coupure. Afin d'atteindre ce but, nous allons identifier toutes les interactions incluant les bases des ribonucléotides composant le coeur catalytique de ce ribozyme. Pour ce faire, nous utiliserons l'approche de sélection in vitro (SELEX). Malgré son utilisation commune pour l'étude du ribozyme delta , l'approche de SELEX n'a jamais donné de résultats concluants au sujet de la tectonique de ce ribozyme pendant l'événement de coupure. Ceci est dû au fait que dans toutes les analyses précédentes, le site catalytique de ce ribozyme n'a jamais été totalement dégénéré. Par conséquent, nous avons développé une stratégie de SELEX unique qui nous permettra éventuellement de dégénérer tous les nucléotides du site catalytique et de sélectionner tous les ribozymes actifs existant dans une banque combinatoire."--Résumé abrégé par UMI.