Implication de hnRNP A1 dans l'épissage des longs introns

Abstract

L'épissage est un processus très répandu dans la cellule. Quatre-vingt-dix-neuf pour cent des gènes subissent au moins un événement d'épissage. Environ 25% du génome correspond aux introns, soit les séquences habituellement non-codantes. Leur longueur moyenne est de 1500 paires de bases, mais certains introns ont jusqu'à plusieurs kilobases. Il est difficile de comprendre comment la cellule s'y prend pour sélectionner une paire de sites d'épissage sur une aussi grande distance. Nous avons tenté de montrer l'implication que la protéine hnRNP A1 pourrait avoir dans l'épissage des longs introns en se basant sur un modèle dérivé de son rôle dans l'épissage alternatif. Notre modèle propose que les protéines A1, après liaison à l'ARN près des sites d'épissage, interagiraient entre elles permettant de rapprocher les sites d'épissage. Le présent compte-rendu montre que la présence de sites de liaison pour A1 à l'intérieur d'un long intron augmente son efficacité d'épissage, que l'addition de plus de deux sites de liaison pour A1 allant jusqu'à quatre sites n'augmentait pas davantage l'efficacité d'épissage, mais que la position de ces deux sites à l'intérieur de l'intron l'influençait. De plus, nous avons tenté de montrer que l'augmentation de l'efficacité était bien médiée par A1 en présence de son site de haute affinité. La présence de sites de liaison pour A1 semble donc augmenter l'efficacité de son épissage, possiblement par l'intermédiaire de la formation d'une loupe permettant de rapprocher les sites d'épissage.