Identification et caractérisation des pauses transcriptionnelles stabilisées par une tige-boucle chez Escherichia coli

Abstract

Bien que nous ayons fait des progrès monumentaux durant les dernières décennies en ce qui concerne notre compréhension de la biologie moléculaire, et par extension des fondements de la vie, d’innombrables questions demeurent. En effet, les mécanismes les plus subtils permettant à la vie de s’épanouir sont encore, pour la plupart, obscurs et mécompris. C’est donc dans l’optique d’éclaircir les principes de la transcription que nous avons réalisé les travaux suivants. La transcription est un procédé essentiel permettant de transformer l’information contenue dans les gènes en outils puissants constituant la vie telle que nous la connaissons, des plus infimes bactéries au plus grand mammifère. En revanche, notre compréhension de la transcription demeure encore bien humble, ce pourquoi des modèles plus simples, comme la bactérie Escherichia coli, sont utilisés pour son étude. Les travaux suivants se penchent principalement sur le déroulement des pauses transcriptionnelles, un mécanisme de régulation dont l’importance a été jusqu’à présent sous-estimée. Grâce aux récentes technologies de séquençage, il a été démontré que des pauses transcriptionnelles se produisent des dizaines de milliers de fois dans le génome d’une bactérie. Nous en avons choisi quelques-unes et les avons caractérisées grâce à des techniques d’identification de la transcription in vitro. Ainsi, nous avons découvert que certaines pauses jusqu’alors méconnues répondent ou non à des structures secondaires d’ARN, en plus de clarifier encore plus le comportement des pauses déjà connues.