Étude structurale des riborégulateurs thiB et thiM

Abstract

L’adaptation de la bactérie à son milieu s’effectue par la régulation de l’expression génétique qui est réalisée pendant l’étape de la transcription, ou pendant l’étape de la traduction. Les protéines jouent un rôle régulateur très important. Nous savons maintenant que les ARN non traduits comme les riborégulateurs sont impliqués aussi dans cette régulation comme c’est le cas également des protéines. Un riborégulateur se trouve dans la partie non codante de l’ARN messager capable de lier un ligand spécifique afin de réguler l’expression de son transcrit. Chez Escherichia coli (E. coli), trois riborégulateurs lient la thiamine pyrophosphate (TPP) : le riborégulateur thiB qui contrôle le transport de TPP, le riborégulateur thiM qui encode le gène du sauvetage de TPP et le dernier, le riborégulateur thiC qui est parmi les gènes régulant la synthèse de TPP. Mes travaux de recherche portent sur l’étude de la structure des riborégulateurs thiB et thiM d’E. coli. Dans un premier temps, j’ai étudié la structure de thiB par deux approches scientifiques; la première est une méthode chimique (SHAPE) et la deuxième, enzymatique (RNase H). Dans un second temps, j’ai commencé à mettre au point une technique de transcription couplée à des billes pour étudier la structure de thiM.