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dc.contributor.advisorOuangraoua, Aïda
dc.contributor.advisorWang, Shengrui
dc.contributor.authorKuitche Kamela, Esaiefr
dc.date.accessioned2020-07-31T16:54:48Z
dc.date.available2020-07-31T16:54:48Z
dc.date.created2020fr
dc.date.issued2020-07-31
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11143/17245
dc.description.abstractL’informatique est de plus en plus utilisée pour résoudre des problèmes dans divers domaines. C’est ainsi qu’avec l’accroissement des données biologiques générées par les techniques expérimentales à haut débit, la bio-informatique intervient pour tirer profit de ces masses de données et contribuer à l’avancement des connaissances en sciences biologiques. La bio-informatique est un domaine interdisciplinaire ayant pour but d’étudier et de résoudre des problèmes computationnels issus des sciences biologiques. Un des problèmes intemporels étudié en bio-informatique est la reconstruction de l’histoire évolutive de génomes, qui sous-entend essentiellement celle des gènes. Les gènes sont le support de l’information génétique et sont les unités de base de l’hérédité. De nos jours, un grand nombre de maladies, telles les cancers, ont une base génétique. Une bonne compréhension de l’évolution des gènes permettrait de mieux comprendre les processus impliqués dans ces maladies pour mieux les traiter. De plus, les connaissances sur l’évolution de gènes sont utiles pour la prédiction et l’annotation de nouveaux gènes. Il a été montré que les gènes eucaryotes subissent un phénomène d’épissage alternatif qui permet aux gènes de produire plusieurs transcrits différents afin de se diversifier fonctionnellement. C’est dans ce contexte que se situe cette thèse de doctorat. L’objectif de la thèse est de définir des modèles et des algorithmes efficaces et précis pour la segmentation de séquences biologiques et la reconstruction de leurs histoires évolutives en tenant compte de l’épissage alternatif. Dans cette thèse, j'ai contribué à accroître les connaissances scientifiques en introduisant et en formalisant des modèles d’évolution de transcrits et de gènes. Nous avons proposé deux algorithmes pour la segmentation de transcrits alternatifs. Nous avons également proposé un outil de simulation de l’évolution des séquences biologiques et un outil de visualisation de coévolution. Pour chacun des modèles et algorithmes proposés, nous avons développé des applications pour permettre l’utilisation facile de nos outils.fr
dc.language.isofrefr
dc.publisherUniversité de Sherbrookefr
dc.rights© Esaie Kuitche Kamelafr
dc.rightsAttribution - Partage dans les Mêmes Conditions 2.5 Canada*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-sa/2.5/ca/*
dc.subjectÉpissage alternatiffr
dc.subjectArbres phylogénétiquesfr
dc.subjectSegmentation de séquencesfr
dc.subjectSimulation de l’évolution de séquencesfr
dc.subjectRéconciliation phylogénétiquesfr
dc.subjectArbres de transcritsfr
dc.subjectArbres de gènesfr
dc.titleModèles et algorithmes pour la segmentation de séquences biologiques et la reconstruction de leurs histoires évolutivesfr
dc.typeThèsefr
tme.degree.disciplineInformatiquefr
tme.degree.grantorFaculté des sciencesfr
tme.degree.levelDoctoratfr
tme.degree.namePh.D.fr


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