Caractérisation de la famille MT, ADN modérément répétitif récemment identifié chez la souris

Abstract

La molécule hybride RmI est un produit d'excision de l'ADN de cellules de souris transformées par le mutant ts-P155 du virus du polyome. Cette molécule est constituée d'un génome viral complet et d'une insertion de 1628 pb d'origine cellulaire (Ins). Ins est composé d'ADN modérément répétitif encadré de séquences uniques, et parmi les dix fragments obtenus par clivage de Ins avec MboI, ce sont les fragments MboI-3, 9, 10, 6 et 8 qui renferment l'ADN répétitif. Il a été démontré que le fragment MboI-3 contenait une homologie de séquence avec l'élément B2 de la souris (Sylla et al., 1984b), alors que la séquence répétitive des autres fragments MboI ne pouvait être rattachée à aucune des familles d'ADN répétitif identifiées à ce moment-là chez la souris. Nous avons sélectionné, d'une banque génomique de souris, des recombinants lambda qui présentaient une homologie de séquence avec les fragments MboI-9+10, MboI-6 et MboI-8 de Ins. De ces recombinants, nous avons isolé trois fragments distincts renfermant chacun l'homologie avec Ins et les avons insérés, séparément, dans les vecteurs plasmidiques pUC13 et pAT153. Les recombinants pAT ont servi à former des molécules hétéroduplex qui nous ont permis de déterminer la longueur approximative de la séquence répétitive en question. De ce fait, il a été possible de sous-cloner dans pUC13, des fragments plus courts contenant l'ADN répétitif homologue à celui de Ins, pour en déterminer la séquence nucléotidique. Cette analyse nous a permis de définir la séquence consensus complète d'une famille répétitive nouvellement identifiée chez la souris, la famille MT. Nos résultats démontrent que la famille MT regroupe des "short interspersed repeated elements" présentant les caractéristiques associées aux rétroposons, c'est-à-dire une extrémité 3' riche en résidus A et une courte répétition directe flanquant l'élément répétitif, ce qui suggère un mode de dispersion par rétrotransposition.